吉林大学生物与农业工程学院教授于建群，先后为本科生主讲“机械设计基础”、“机械设计”、“气液压传动”、“包装结构设计”、“机械优化设计”等6门课程;为研究生主讲过“系统建模与仿真”、“离散元法及其应用”、“生物芯片及其应用”等3门课程。
在任学校系主任期间，于建群负责和主持吉林大学“农业机械化及其自动化”本科专业建设及改革工作，2006年获批吉林省高等教育教学研究课题“现代农业机械化及其自动化专业人才培养方案的研究与实践”，同时获批“十一五”和“十二五”吉林省特色专业建设项目，2009年获批教育部修购资金建设项目“农业机械化及其自动化本科实验教学平台建设设备购置”，2010年获批教育部“卓越工程师培养计划”试点项目，2011年与中国农业机械化科学研究院共同获批教育部“农业机械化工程国家级工程实践教育中心”建设项目，2012年获批教育部高等学校“专业综合改革试点”项目。发表教学研究论文2篇。
作为项目负责人的于建群，设计并研制出新型精密排种器——组合内窝孔精密排种器，系统建立了该排种器的设计理论和设计方法。该排种器经吉林省科技厅组织专家鉴定达到国际先进水平，获国家发明专利(ZL专利号97122327.0)并技术转让4个生产企业，使用该排种器开发的多种型号玉米精密播种机在吉林省十多个市、县推广应用，2001年，于建群获吉林省科技进步三等奖。
多年来，于建群作为项目主要参加人参与设计和研制的2BDY—6型高速气力精密播种机、2BM—6型精密播种机、2BS—2型精密播种机、1GH—2型根茬粉碎还田机等6种新机具，获2项国家发明专利并技术转让4个生产企业，在黑龙江和吉林2个省10多个市县推广应用，相关研究成果分别获2000年中国高校技术发明二等奖、2003年中国机械工业科技进步一等奖和2003年国家科技进步二等奖。
2003年，于建群开始了农机数字化设计的研究工作，提出由农机部件的CAD模型(CAD软件设计图)建立其离散元法分析模型的方法，实现了三维CAD软件与自主研制的三维离散元法(DEM)软件、三维计算流体动力学(CFD)软件、三维多刚体动力学(MBD)软件的集成，从而开发出具有自主知识产权的集设计和性能分析评价为一体的新型CAE软件——AgriDEM。该软件的特点是：在设计阶段，通过修改农机部件的CAD模型，能对不同结构和尺寸的农机部件进行性能分析和评价，由此实现农机部件结构方案和尺寸参数的优化;通过农机部件的CAD模型，能进行农机部件工作过程的动态仿真，由此分析农机部件的工作机理、结构及尺寸参数和运动参数对其性能的影响，为农机部件的优化设计提供一种新方法。完成国家863项目1项(2006AA04Z125)和国家自然科学基金项目5项
(60673033、50775097、60973090、11172112、51175219)，在研国家自然科学基金项目1项(51675218)，获国家发明专利3项(200510016835.7、201110303054.1、201110293826.8)，获软件著作权15件，发表研究论文40余篇。研究论文“离散元法及其在农业机械工作部件研究与设计中的应用”，被评为农业工程学报2004-2005年度优秀论文。